01 保持預處理效果的穩定
在預理處階段去除原水中的大部分污染物。良好的預處理效果，能夠有效減少反滲透系統受到各類污染的機率。(例如定期更換保安過濾器濾芯和檢查保安過濾器，防止過濾器內出現短流現象和滋生生物粘泥而對膜元件造成污染;嚴格控制進水濁度和污染指標(SDI)，控制進水濁度小于0.5NTU，污染指數小于5；對膜前流程及膜系統進行消毒殺菌，消毒殺菌對控制微生物污染是的關鍵步驟。對系統的殺菌分為沖擊式殺菌和連續性殺菌，可根據系統不同而選用不同的方法)
02 控制較低的運行壓力和回收率
壓力是反滲透脫鹽的推動力，壓力升高，膜組件透水量線性上升，脫鹽率開始時升高，當壓力升至一定值時，脫鹽率趨于平穩。因而在實際運行中，壓力無需太高，壓力過高會使膜的衰減加劇，而且有可能損壞膜組件。為延長膜組件的使用壽命，通常在脫鹽率和產水量滿足生產要求時，采用稍低一些的壓力運行，對系統的長周期運行有著的好處。
當反滲透系統采用較高的回收率時，濃水含鹽量相應提高，不但容易在濃水側產生濃差極化，而且會導致系統滲透壓的增大，為維持產水量，操作壓力必須提高，產水的比能耗也會增加，產水水質變差，膜污染加重，結垢和微生物污染的危險性變大。根據運行經驗，反滲透系統的回收率控制在75%以下比較合適。
03 對膜進行物理清洗(產品水沖洗)
沖洗是采用低壓大流量的進水沖洗膜元件，沖洗掉附著在膜表面的污染物和堆積物，膜的低壓沖洗可以減少深度差，防止膜脫水現象的發生。在條件允許的情況下，建議經常對系統進行沖洗。增加沖洗次數比進行一次化學清洗更有效果。
04 規范系統啟停操作及停運保護措施
系統啟動和停止時，流量和壓力會有波動。過大、過快的流量和壓力波動可能會導致系統發生極限壓降現象，形成水錘作用，從而導致膜元件破裂，故在進行啟停止操作時需緩慢增加或者降低壓力及流量。
系統的開機前和停運時，應確保壓力容器內沒有真空，否則當再次啟運膜元件的瞬間會出現水錘或者水力沖擊，當已經漏掉水分的系統在初始開機或一般運行啟動時，就會出現上述現象。
系統應保持較低的背壓(產水側壓力)，產水側壓力高于原水側壓力0.05MPa以上時，膜元件會受到物理性損傷。系統啟動和停止運行前，要充分確認閥門的開和關以及壓力的變動，保證運行過程中杜絕背壓現象發生。如果膜系統需要長時間停運，則需要根據技術手冊要求，向系統內通入保護液或者定期通水來保證膜元件的正常備用。
05 定期對膜元件進行在線化學清洗
采用了合理的預處理系統和良好的運行管理，它只能使膜元件受污染的程度有所降低，要*消除膜的污染是不可能的。因此，反滲透膜系統運行一段時間后，將可能受到多種污染物的污染，尤其是使用在污水深度處理裝置的反滲透膜系統，污染更是經常發生一般情況下，經過標準化后的產水量下降15%左右，進水和濃水之間的系統壓降升高到初始值的1.5倍，產水水質有明顯下降，就需要對膜元件進行化學清洗。
化學清洗時，首先要判斷污染物種類，然后根據膜的特性選擇合適的清洗配方和清洗工藝。清洗時要注意控制清洗液的pH值、溫度和清洗液的流量。為了保證沖洗效果，具備條件的可以采用分段清洗的方法進行化學清洗。目前國內及國際已經有化生產的膜專用清洗藥劑供選擇使用(上海瑩潤環保)。清洗效果可以通過比較清洗前后的裝置的脫鹽率、產水量和壓降等性能來確認。
06 對膜元件進行離線化學清洗
當膜系統經過多次在線化學清洗后無法恢復性能，或者膜系統受到重度污染后，則需要對膜元件進行離線化學清洗。膜元件的重度污染是指污染后的單段壓差大于系統投運初期單段壓差值的2倍以上、反滲透系統產水量下降30%以上或者單支反滲透膜元件質量超過正常數值3kg以上的情況。
根據用戶原水全分析報告、性能測試結果及所了解的系統信息判斷污染類型及清洗流程；必要時再通過特殊的設備、器具作進一步的驗證，以確定具體污染物類型，確定所需清洗配方。將拆下了待清洗膜元件在專用離線清洗設備上進行清洗，清洗后經過檢測合格后回裝投用。
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